Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MsraQ9D6Y7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MsraQ9D6Y7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MsraQ9D6Y7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms