Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clvs1Q9D4C9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clvs1Q9D4C9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Clvs1Q9D4C9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clvs1Q9D4C9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms