Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gpn3Q9D3W4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpn3Q9D3W4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpn3Q9D3W4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms