Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx29Q9D3S3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx29Q9D3S3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx29Q9D3S3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx29Q9D3S3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms