Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F7

Ddit4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit4Q9D3F7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddit4Q9D3F7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit4Q9D3F7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddit4Q9D3F7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms