Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ToporslQ9D2F8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ToporslQ9D2F8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ToporslQ9D2F8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.8 ms