Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Necap2Q9D1J1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necap2Q9D1J1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms