Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl53Q9D1H8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl53Q9D1H8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl53Q9D1H8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.7 ms