Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem88Q9D0N8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem88Q9D0N8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem88Q9D0N8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms