Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pbdc1Q9D0B6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pbdc1Q9D0B6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pbdc1Q9D0B6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pbdc1Q9D0B6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms