Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Elp3Q9CZX0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Elp3Q9CZX0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Elp3Q9CZX0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Elp3Q9CZX0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms