Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
3100002H09RikQ9CXW6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
3100002H09RikQ9CXW6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
3100002H09RikQ9CXW6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
3100002H09RikQ9CXW6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms