Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
3300002I08RikQ9CXH3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.4 ms