Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vta1Q9CR26 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vta1Q9CR26 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vta1Q9CR26 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vta1Q9CR26 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vta1Q9CR26 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vta1Q9CR26 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vta1Q9CR26 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vta1Q9CR26 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vta1Q9CR26 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vta1Q9CR26 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vta1Q9CR26 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vta1Q9CR26 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vta1Q9CR26 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms