Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ykt6Q9CQW1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ykt6Q9CQW1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms