Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mrpl11Q9CQF0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mrpl11Q9CQF0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms