Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ergic3Q9CQE7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ergic3Q9CQE7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ergic3Q9CQE7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ergic3Q9CQE7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ergic3Q9CQE7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ergic3Q9CQE7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms