Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms