Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
StambpQ9CQ26 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
StambpQ9CQ26 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
StambpQ9CQ26 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms