Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atg3Q9CPX6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atg3Q9CPX6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atg3Q9CPX6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms