Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sike1Q9CPR7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sike1Q9CPR7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms