Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bap1Q99PU7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bap1Q99PU7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bap1Q99PU7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms