Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP6

Trim34a, Tripartite motif-containing protein 34A, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34aQ99PP6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim34aQ99PP6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim34aQ99PP6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim34aQ99PP6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim34aQ99PP6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim34aQ99PP6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim34aQ99PP6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trim34aQ99PP6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim34aQ99PP6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim34aQ99PP6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim34aQ99PP6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim34aQ99PP6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.8 ms