Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Pcgf6Q99NA9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Pcgf6Q99NA9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Pcgf6Q99NA9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Pcgf6Q99NA9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Pcgf6Q99NA9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms