Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hdac9Q99N13 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hdac9Q99N13 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hdac9Q99N13 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms