Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp16Q99LG0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp16Q99LG0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp16Q99LG0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms