Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf34Q99KR6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf34Q99KR6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf34Q99KR6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf34Q99KR6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1208.9 ms