Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrabdQ99JY4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrabdQ99JY4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrabdQ99JY4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms