Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EpcamQ99JW5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EpcamQ99JW5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms