Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrbp1Q99J45 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nrbp1Q99J45 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nrbp1Q99J45 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrbp1Q99J45 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nrbp1Q99J45 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms