Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctu1Q99J10 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctu1Q99J10 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctu1Q99J10 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctu1Q99J10 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctu1Q99J10 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctu1Q99J10 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctu1Q99J10 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctu1Q99J10 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ctu1Q99J10 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctu1Q99J10 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms