Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prss28Q924N9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prss28Q924N9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prss28Q924N9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms