Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Traf7Q922B6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Traf7Q922B6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Traf7Q922B6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms