Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HlcsQ920N2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HlcsQ920N2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HlcsQ920N2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HlcsQ920N2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HlcsQ920N2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HlcsQ920N2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HlcsQ920N2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HlcsQ920N2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HlcsQ920N2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HlcsQ920N2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HlcsQ920N2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HlcsQ920N2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HlcsQ920N2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms