Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdhb12Q91Y07 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcdhb12Q91Y07 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdhb12Q91Y07 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms