Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Basp1Q91XV3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Basp1Q91XV3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms