Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx15Q91WE1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx15Q91WE1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms