Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itm2cQ91VK4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itm2cQ91VK4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Itm2cQ91VK4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms