Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Crb1Q8VHS2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Crb1Q8VHS2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Crb1Q8VHS2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Crb1Q8VHS2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Crb1Q8VHS2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Crb1Q8VHS2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms