Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms