Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cbx7Q8VDS3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cbx7Q8VDS3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cbx7Q8VDS3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms