Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dnajc28Q8VCE1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnajc28Q8VCE1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajc28Q8VCE1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms