Protein–RNA interactions for Protein: Q8R480

Nup85, Nuclear pore complex protein Nup85, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup85Q8R480 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup85Q8R480 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup85Q8R480 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup85Q8R480 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms