Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd8Q8R3B7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Brd8Q8R3B7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd8Q8R3B7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms