Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip5Q8R361 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab11fip5Q8R361 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11fip5Q8R361 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab11fip5Q8R361 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip5Q8R361 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip5Q8R361 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip5Q8R361 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip5Q8R361 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab11fip5Q8R361 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms