Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nup58Q8R332 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup58Q8R332 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup58Q8R332 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup58Q8R332 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup58Q8R332 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup58Q8R332 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup58Q8R332 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup58Q8R332 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup58Q8R332 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup58Q8R332 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup58Q8R332 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms