Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gtf3c5Q8R2T8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf3c5Q8R2T8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf3c5Q8R2T8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms