Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf183Q8QZS5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf183Q8QZS5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms