Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4S1

Plce1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 2,282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plce1Q8K4S1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plce1Q8K4S1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plce1Q8K4S1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Plce1Q8K4S1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plce1Q8K4S1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Plce1Q8K4S1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Plce1Q8K4S1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Plce1Q8K4S1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Plce1Q8K4S1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plce1Q8K4S1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plce1Q8K4S1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plce1Q8K4S1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plce1Q8K4S1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plce1Q8K4S1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plce1Q8K4S1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms