Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms