Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
OptnQ8K3K8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OptnQ8K3K8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OptnQ8K3K8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
OptnQ8K3K8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms